徳島県の在来の"シャモ"を畜産試験場で10年間改良を重ね、その雄と他の優良肉鶏をかけ合わせて作った高級肉用鶏です。
昭和50年代から、徳島県立農林水産総合技術支援センター畜産研究課（当時の畜産試験場）で開発が始まりました。
父鶏（雄）は 徳島県内で古くから飼育されていた赤笹系軍鶏（シャモ）を改良。肉質が低脂肪でコク・甘み・旨みが強く、歯ごたえが良い点。
母鶏（雌）は 優良な肉用鶏種であるホワイトプリマスロックが、相性の良さや穏やかな気性、産卵数の多さから選ばれました。
1998年（平成10年）度には「新しい地鶏」として人気を集め、地鶏の出荷量が全国1位となりました。
2001年（平成13年）には初めて特定ＪＡＳ地鶏認定を受けました。
この特定ＪＡＳ規格では、血統（地鶏血統50％以上）、飼育密度（28日齢以降、飼育面積1㎡当たり10羽以下の平飼い） 飼育日数（75日以上）が条件として決められ、この規格をクリアしたものだけが「阿波尾鶏」となります。
2023年（令和5年）3月31日には、地理的表示（GI）保護制度に登録されました。